Töökeskkonna auditi eesmärgiks on kontrollida ettevõtte tegevuste vastavust töötervishoiu ja tööohutuse seadusele, juhtimissüsteemis kirjeldatule ning teistele nõuetele ja kohustustele, mis reguleerivad ettevõtte töökeskkonna ohutust.

Töökeskkonna auditi eesmärgid lepitakse kokku auditi eelse konsultatsiooni käigus. Auditeerida on võimalik ka ainult konkreetseid teemasid nagu näiteks dokumentatsiooni vastavust või kvaliteedi juhtimissüteemi toimimist.

Vajadusel viiakse audit läbi ettevõtte siseauditi formaadis, täitmaks kvaliteedi juhtimissüsteemi nõuet viia läbi perioodiline siseaudit, kaasates seejuures kõiki vajalikke osapooli.